医学院办学历史可追溯到1958年成立的“铜仁专区医学专科学校”。历经“贵州省铜仁专区卫生学校”“贵州省铜仁卫生学校”“贵州省铜仁地区卫生学校”等名称。2002年，铜仁地区卫生学校与农校、商校、财校、职校合并组建铜仁职业技术学院，成为铜仁职业技术学院的重要组成部分--医学系。2007年，组建护理系，医学系与护理系分开办学，2012年改系为院，医学系改名医学院。

医学院现开设康复治疗技术、临床医学、医学影像技术、医学检验技术等专业，现已建成以康复治疗技术专业为核心的康复治疗省级专业群。康复治疗技术专业为省级骨干专业，2019年被认定为国家级骨干专业，康复治疗技术专业人才培养方案获省级示范性人才培养方案；临床医学专业为学院唯一的国控专业；医学检验技术专业为2012年中央财政支持重点专业建设项目；数字化医学影像开放实训基地被教育部认定为国家级生产性实训基地；学院是第二批全国急救校试点院校。

医学院先后荣获贵州省抗击新冠肺炎疫情先进集体，铜仁市教育系统先进集体，铜仁市五一劳动奖状；“铜仁市五好基层党组织”等荣誉称号；多名教师荣获“省级职教名师”“贵州省优秀科技个人”“贵州省优秀教师”“铜仁市优秀教师”“铜仁市优秀教育工作者”等表彰；多个班级及学生曾荣获省市级各类表彰，如“贵州省大学生先进班集体”“国家奖学金”“全省优秀大学生”等。

医学院秉承仁爱济世、知行合一的院训精神，为社会培养了大批下得去、用得上、留得住的医学专业人才。学生在职业院校技能大赛中多次荣获省级二等级、一等奖及国家级三等奖的好成绩。自2007年来累计培养毕业生1万余人，国际学生200余人，培养政府订单生900余人，为学校发展壮大及区域医药卫生事业的发展做出了重要贡献。